美日菲三国峰会加强同盟关系，对本区域的安全环境有重大影响。国际政治学者认为，接下来美国与中国，中国与日本及菲律宾都应该加强对话，减少误解或争端升级的可能。
南洋理工大学人文、艺术与社会科学院院长廖振扬教授接受《联合早报》采访时评估这次峰会称，这是一次重要且具有开创性的会议，可能对安全环境产生重大影响。
“很显然，菲律宾评估后认为，加强与美国的联盟最符合他们的利益。同时，协议也让日本能够在本区域发挥更积极的作用。”
廖振扬说，中国不满美日菲达成协议，“但对他们来说，深入评估是什么原因让这三个国家更加紧密地联系在一起，对中方才是有帮助的。中方最简单的解释是，美国策划了一切，但我不认为这是唯一的原因”。
过去一年多，中菲不时在南中国海发生冲突，中方多次阻扰菲律宾补给船前往阿云津礁（中国称仁爱礁），给驻守的马德雷山号军舰运送物资。中国认为是菲律宾主动挑衅，拉拢域外国家介入南中国海主权纠纷。
重新思考如何实现地区和平稳定
新加坡国立大学李光耀公共政策学院东亚国际关系助理教授柳庸煜（Ryu Yongwook）受访时说，经过这次峰会后，区域国家须关注至少三个要点：北京如何看待解读美国及盟友的行为、美国的支持可能造成盟友任性而为、区域国家须重新思考如何实现地区和平稳定。
他指出，区域国家逐渐深陷中美战略竞争的泥淖，而没有更批判地思考自己的角色以及亚细安等区域一体化组织的作用。
“结果中小国家的政策空间缩小，亚细安的中心地位沦为各国政府在制定区域战略时挂在嘴上的东西，而没有认真对待。区域形势应该由相关国家来共同塑造，而不只是由大国来塑造。”
今后南中国海局势如何发展，是各国的关注点之一。廖振扬认为，当前更迫切需要美国和中国、中国和日本及菲律宾建立与加强对话机制，减少误解和曲解对方举动的可能性。
有分析指出，美日菲防卫合作将对中国在东海及南中国海的活动产生强大的威慑效果。
中国南开大学周恩来政府管理学院副教授黄海涛受访时说，美国对菲律宾有其布局考量，但又不愿深度介入。
“从美国的角度而言，对菲律宾的行为顺水推舟地加以勉励，既符合它的印太战略的总体布局，又能够深度绑定菲律宾的未来发展轨迹，以免再次出现如之前杜特尔特政府的‘脱缰’之举。”
“但美国显然也不愿意在大选年且深陷俄乌、以哈两场冲突之际，又在南中国海爆发新冲突。这就是为何美日菲三边峰会实际上闪烁其词，在安全承诺上仅仅重申既有条约义务，在多边制度化建设方面并没有更多进展，政策话语仍较为保守的原因。”
日本冀发挥更大海洋安全作用
日本舆论认为，日美首脑峰会的最大成果是双方达成军事一体化继续升级的协议。日美菲扩大防卫合作，则提升了日本对中国的“横向威慑力”，日本可以在维持海洋安全方面发挥更大作用。
近年来，中国在东亚海域更强势，朝鲜加强发展核武和导弹。《读卖新闻》分析指出，日美为应对这些安全挑战，正在建立一套能快速应对紧急情况的军事指挥体系，包括美国把印太司令部的部分权力移交驻日美军司令部，以方便美军与自卫队联合行动。
“毫无疑问的是，这些努力将使美军和日本自卫队能够更一体化运作，增强威慑力。”
美日首脑峰会星期三（4月10日）达成70多项协议，重点包括驻日美军司令部现代化协议。驻日美军将重组为一个联合作战司令部，日本也将成立联合作战司令部，两国军队在面临诸如中国大陆攻打台湾的危机时，能更加灵活地应对。这是两国在1960年代进行防务合作以来的最大升级。
据《朝日新闻》报道，明海大学海上防卫专家小谷哲男指出，日本在尖阁诸岛（中国称钓鱼岛）主权问题上单独应对中国，是一种“垂直威慑”。日美在南中国海问题上支持菲律宾，是要让中国知道，这种合作也适用于尖阁诸岛，对中国形成“横向威慑”。这要比日本单靠自己应对中国有效。
日本放送协会（NHK）的分析指出，如果放任中国强势改变南中国海现状，同样的情况会蔓延到本区域其他海域。由于美国面对俄乌战争和以哈冲突，无法分身应对东亚的问题，因此美国会进一步敦促日本发挥作用，包括向菲律宾提供更多的安全措施，以及推动经济安保合作。
