金厦海域翻船案的两名生还渔民回到中国大陆后，其中一人含泪控诉快艇是被台湾海巡艇撞翻。面对渔民控诉和家属疑虑，台湾海巡署没拿出录影来反驳，反改口称在驱离和翻船过程中没有录影，但承认两船多次碰撞。
一艘大陆快艇上星期三（2月14日）下午越界闯入金门海域，该处离金门东南方的北碇岛只有0.86海里（约1.6公里）。台湾海巡艇展开追缉后，大陆快艇翻覆，船上四人全落海，其中两人送医抢救不治身亡。
两名生还渔民星期二（20日）下午从金门返回厦门，随后回到泉州。两名死者的家属则对验尸结果有疑虑，拒绝火化遗体，目前还在金门，未决定是否对台方提告。
中国央视新闻旗下新媒体“玉渊谭天”，星期三（21日）下午在微博发布题为《生还渔民揭露台粗暴对待大陆渔船真相》的视频。其中一名渔民叙述事发经过时说，当天中午12时出发，12时50分就看到台湾海巡艇冲着他们的船开过来。
渔民称：“我们自己船怎么可能翻掉？开急转弯也翻不掉，要被撞才会翻掉。”“（台湾海巡艇）冲一下把我们顶翻掉了，我们就钻到水里面跑出来，四个人只有两个人上岸。”
他感慨说：“我们两边的渔民打渔，我们没对他怎么样，他们以前跑到我们这边来，我们对他们很好。这次他们对我们这样，太失望了。”他随后落泪，感谢大陆方面让他们安全回家。
事发隔天（2月15日）海巡署副署长张忠龙称，涉案大陆快艇“蛇行拒检，不慎翻覆”，没提碰撞。随后，海巡署以侦查不公开为由拒绝交出事发录影，台湾政府海洋委员会主委管碧玲则称，追缉录影约五分钟，决定先交检调部门调查，过后才公布。
星期二（2月20日）大陆渔民家属抵达金门。面对公开录影的声浪，金门地检署主任检察官施家荣晚上宣称，经讯问金门海巡队，执勤队员说当时双方超高速行驶，不慎发生碰撞，大陆快艇当场翻覆，四名船员落海，因急着救人而忘了录影。
台湾海巡署星期三也称，在驱离和翻船过程并无录影，海巡艇也没配备全船监视系统，并承认海巡艇与大陆快艇在高速追逐下“船身多次接触”。执法人员因专注维持平衡和准备强靠登检，无法拿摄影器材搜证。
这起事件引发北京公开否定台湾方面划定的水域线。根据台湾施行的两岸人民关系条例，在金门和马祖等外岛，离岸24海里是限制水域，离岸12海里则是禁止水域。
大陆海警2月18日宣布将在金厦海域开展常态化执法巡查，过后连续三天都出现，包括星期三下午，两艘海警船现踪离金门岛七海里的海域，三艘大陆海监船出没在马祖海域、其中一艘离马祖的南竿岛约5.5海里。海监船隶属于大陆国家海洋局，一般以中国海警局名义出海维权执法。
随着两岸情势升温，台湾国防部星期三要求外岛防卫部和海军模拟冲突和处置的情境，纳入演练并做好冲突资源准备。美国国务院发言人也呼吁北京保持克制，与台湾进行有意义对话，减少误判风险。
大陆国台办发言人朱凤莲星期三强烈谴责台方粗暴对待大陆渔民、漠视生命“暴力执法”又刻意隐瞒事实真相，严正要求台方尽快公布真相，严惩相关责任人，给遇难者家属和两岸同胞一个明确交代。
台湾海巡署星期三晚上也针对渔民指控发出四点声明，包括虽然无法全程录影，但不影响事实真相，并指两名生还渔民在调查笔录中表示，对海巡队执法程序无异议。
